Eur J Endocrinol：石蜡标本转录组分析在肾上腺皮质胰脏诊断和预后中的价值

历史背景：性腺胰脏(ACC)是一种有名的内分泌胰脏(每年每百万的有会有1-2例)，总体结节病极差。检验对病患者管理至关举足轻重，但由于这种癌症的有名，检验很困难。事实上，在性腺(ACT)中会，ACC是有名的，大多数是性腺腺瘤(ACA)。病理恶性评分称为Weiss评分，最常用作检验。然而，具有中会等评分和有名四解剖人体内的不容易被类群。特别是，未确定由大细胞核和少时溶颗粒四组成的少时溶人体内体的恶性是具有挑战性的。

ACC的5年总体生存率一般低于40%，但表征。结节病分层对监督治疗决策很举足轻重，特别是在主要用途治疗。临床上使用的亦然要结节病环境因素是分期Ki-67增殖指数。其他结节病环境因素通常还包括皮质醇分泌和岁数。

以当年的蛋白质四组研究工作表明，蛋白质四组变转化高度集中会在有所不同的水分子HIV-。核糖体四组著者是水分子类群的基石。核糖体四组著者将性腺腺瘤与胰脏区分开来，并确认借助于两四组与结节病密切相关的ACC：“C1a”亚四组，其增殖蛋白质过度暗示，结节病不良；“C1B”亚四组，具有免疫特征，结节病较好。从核糖体四组特征，已推断借助于特定的mRNA上面，如BUB1BPINK1的差异蛋白质暗示。这些靶向上面物更佳了ACC的检验和结节病评估。然而，到目当年为止，核糖体四组著者及其靶向替代上面物值得注意除此以外的RNA，并不需要除此以外的冰冻四组织抽取。在常规实践中会，给予这种类型的材料尽快很高，而对于ACC病患者来说，往往很难实现。

最近的3’RNA测序核心技术捕获并测序了多谷胱甘肽转化RNA 3’端的短相片，这些相片不太容易被RNA降解。与蛋白质暗示molecular或标准的全长RNA测序有所不同，这种核心技术只并不需要少量和低质量的RNA，与氯化钾固定煤油包埋(FFPE)抽取兼容。

目的：亦然要目的是利用新的3’端RNA测序核心技术，未确定氯化钾固定煤油包埋(FFPE)抽取的核糖体四组著者。第二个目的是通过重点研究工作有名的少时酸细胞核ACT变体，示范这种核心技术探求大型FFPE资料的能力。

分析方法：我们纳入131例ACT：来自科钦该医院的锻炼配置文件和来自弗赖堡该医院的独立解析配置文件。用QuantSeq(Lexogen)和NextSeq500(Illumina)从FFPE抽取中会产生3’核糖体四组。

结果：在锻炼配置文件中会，无指派聚类识别借助于3四组：“C1A”型首当其冲性胰脏(N=28，29%)、“C1B”型胰脏(N=28，29%)和“C2”型腺瘤(N=39，41%)。FFPE核糖体四组的结节病效用在解析配置文件中会得到证实(5年OS：C1a四组为26%(N=26)，C1B四组为100%(N=10)，p=0.003)。在还包括分期和Ki-67的多变量模型中会，FFPE核糖体四组是一个独立的结节病环境因素(OS-HR 7.5，p=0.01)。少时溶粒细胞核ACT(N=19)未形成任何特异簇。少时酸细胞核胰脏(N=6)和恶性潜力未明的少时溶细胞核胰脏(N=4)外为“C1B”。

图1.锻炼配置文件中会ACT的FFPE核糖体四组类群A.基于2000个最易变的蛋白质对ACT的非指派类群未确定了三个亦然要四组，对应于“C1A”首当其冲性胰脏、“C1B”气态胰脏和“C2”腺瘤。B.用作生成非指派类群的3个非负标量分解(NMF)等级的热图。雌激素(肾上腺分转化)、增殖和免疫前兆在每种ACT中会的暗示。D.三四组核糖体四组中会差异最显著的当年50个蛋白质的暗示谱。即通过渐进聚类算法表示抽取之间的近似于度的一致性标量。行和列是病患者抽取。诚意标量值的之内从0(从不相聚)到1(即便如此相聚)。

图2.有所不同区域的FFPE核糖体四组类群。对锻炼配置文件中会5名病患者的两个有所不同区域进行苏木巧/伊红/第一圈弗兰染色(放大40倍)，其中会一个为首当其冲性(-a)区，一个为非首当其冲性(-b)区。黑条代表50微米。黑色圆点表示体细胞。深蓝色圆点表示不典型的体细胞。B.描述为5名病患者采样的两个有所不同的区域，其中会一个是首当其冲性(-a)，另一个是首当其冲性(-b)。疲倦用：Fuhrman核级疲倦用作少时溶细胞核。C.基于PCA的两个亦然掺入(Dim1、Dim2)的抽取球面基于锻炼配置文件的95个与众不同病患者中会的2000个最可变蛋白质。来自锻炼配置文件的抽取表明为核糖体四组男生着色的模糊圆圈。来自两个有所不同区域的8名病患者的抽取按病患者的颜色表明为全三角形。

图3.ACC解析配置文件中会的FFPE核糖体四组类群和结节病A.抽取球面基于PCA的两个亦然掺入(Dim1，Dim2)，基于锻炼配置文件中会95个与众不同病患者中会最可变的2000个蛋白质。来自锻炼配置文件的抽取表明为核糖体四组男生着色的模糊圆圈。来自解析配置文件的抽取以核糖体四组类别着色的完整三角形表示。B.根据解析配置文件中会I-III期ACC病患者的预测核糖体四组类型进行无病生存。根据解析配置文件的I-IV期ACC病患者的预测核糖体四组类群，总的存活率。

结论：3’RNA测序法是从FFPE抽取中会未确定ACT水分子类型的一种简便分析方法。这项核心技术应该有助于常规使用和大型回顾研究工作。

原文借助于处：Jouinot A, Lippert J, Sibony M,et al.Transcriptome in paraffin samples for the diagnosis and prognosis of adrenocortical carcinoma.Eur J Endocrinol 2022 Mar 01